根据现今的职业岗位的能力要求和实际工作流程，绍兴市中等专业学校生物技术制药专业以项目或任务的形式，按工作流程进行教学方案设计并实施。
在教学过程中，充分利用校内外实训设施设备，努力实现学习过程与工作流程的一致性。通过学习环境与工作环境相结合，让学生进行理实一体化的实践操作，提高学生操作技能，锻炼学生职业能力。
在项目教学实践中，以学生为本，改革教学评价，学生自评、教师评价为基础，以以实习鉴定、毕业生质量跟踪调查等方式为依托，加入企业第三方评价的元素，使评价成为促进学生发展和能力形成的手段；在评价内容上，包括认知能力、核心技能、合作能力和综合能力的评价；在评价方式上，形成性评价与终结性评价相结合，对学生进行全面全程动态化的评价。改变传统的以终结性的鉴定、选拔为主的评价模式，转向以评价主体多元化、评价内容多样化、评价过程动态化的能力递进式多元评价模式。
学校进一步强化技能教学，对原有的课程结构进行大胆改革。对于专业理论课，教学中摒弃一些不常用、已过时的知识结构，对内容进行大胆的删节，相应的弱化了理论知识。同时对实验实训课也进行一系列变革，如增设实验内容，分小班教学等等，强化了相应的技能，凸显了技能的重要性。
在培养岗位职业能力时，学校通过综合和具体的职业实践活动，帮助学生积累实践经验，融入企业文化，使学生能熟练掌握生物药物生产技能，具备较强的岗位适应性和较高的职业素养，成为市场岗位第一线迫切需要的高素质技能型人才。同时适应职业技能培养特色，实行“双证书”教育，建立与本专业培养目标相匹配的职业技能考核鉴定，或与社会职业资格证书或技术等级证书制度接轨，围绕职业技能培养明确“双证书”教育的实施方式。
